1.2 細胞培養(yǎng) 人支氣管上皮細胞(16HBE)(美國加州大學)由中南大學湘雅醫(yī)學院細胞中心提供,含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)體系6~10 ml,細胞密度1~2×106/ml接種于50 ml培養(yǎng)瓶,于37℃,5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。細胞長滿70%~80%時隨機分為8組:①空白對照組,②TNFα(20 ng/ml,16 h)組,③EM(0.3 μg/ml,24 h)+TNFα(20 ng/ml,16 h)組,④EM(3 μg/ml,24 h)+TNFα(20 ng/ml,16 h)組,⑤EM(30 μg/ml,24 h)+TNFα(20 ng/ml,16 h)組,⑥EM(0.3 μg/ml,48 h)+TNFα(20 ng/ml,16 h)組,⑦EM(3 μg/ml,48 h)+TNFα(20 ng/ml,16 h)組,⑧EM(30 μg/ml,48 h)+TNFα(20 ng/ml,16 h)組醫(yī).學.全.在.線m.52667788.cn。
1.3 逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(RTPCR)
1.3.1 提取細胞總RNA(按Trizol說明書) 取1 ml內(nèi)含1×106個細胞的培養(yǎng)液于1.5 ml Eppendorf離心管中,4℃,2 000 r/min離心5 min,棄上清液。加入1 ml Trizol分離試劑,用移液器吸頭吸打重懸細胞沉淀,室溫孵育5 min。加入0.2 ml氯仿,振搖15 s,室溫孵育10 min。4℃,13 000 r/min離心15 min,收集上層無色水相于1.5 ml Eppendorf管中,棄沉淀管。加入0.5 ml異丙醇,振蕩混勻,室溫孵育5 min。4℃,13 000 r/min離心10 min,棄上清液。加入1 ml 75%乙醇并震蕩。4℃,13 000 r/min離心10 min,棄上清液。真空干燥離心機干燥5 min。加入8 μl DEPC處理水溶解RNA。取2 μl電泳分析RNA質(zhì)量。
1.3.2 逆轉(zhuǎn)錄反應 各組提取的總RNA重懸于6 μl DEPC水中,加入8 U RNasin,Oligod T15(500 ng/μl),ICAM1下游引物50 pmol,混勻,13 000 r/min離心30 s,70℃水浴5 min,然后立即置冰上冰浴(退火)。20 μl RT反應體系中含5×RT緩沖液4 μl,12 U RNasin,4μl 2.5 mmol/L dNTPs,5 U AMV逆轉(zhuǎn)錄酶,然后用DEPC處理水補足終體積至25 μl,輕敲混勻,稍離心,42℃水浴1.5 h后,于-20℃保存。
1.3.3 聚合酶鏈反應(PCR) 取逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為模板,擴增βactin、ICAM1基因。ICAM1,βactin PCR反應條件:取RT反應產(chǎn)物2 μl為模板,加入10×PCR buffer 2μl,2.5 mmol/L dNTPs 2 μl,25 mmol/L MgCl2 1.5 μl,ICAM1上游引物0.5 μl(10 pmol/μl),βactin上、下游引物各0.5 μl(10 pmol/μl),補充消毒雙蒸餾水9 μl,再加入5 U/μl TaqE 1 μl,加入約25 μl左右的礦物油蓋于液面上。擴增參數(shù)為94℃,30 s,57℃,30 s,72℃,30 s,循環(huán)30次,然后72℃延伸10 min,停止,4℃保存。ICAM1擴增片段長度為490 bp,βactin擴增片段長度為260 bp。
1.3.4 cDNAPCR產(chǎn)物電泳和照相分析 取PCR產(chǎn)物5 μl,經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳,以Generuler 100 bp DNA Ladder Marker為分子量標準,英國GENEGENIUS快速成像系統(tǒng)攝影,圖片經(jīng)英國GENEGENIUS圖像分析處理系統(tǒng)分析,對擴增產(chǎn)物條帶進行掃描,記錄光密度值,以ICAM1/βactin的比值作為ICAM1 mRNA表達的相對含量。
1.4 克隆測序 回收ICAM1擴增產(chǎn)物(PCR產(chǎn)物),經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳分離,切膠回收擴增目的片段;按產(chǎn)品說明書要求進行PCR產(chǎn)物與T載體連接反應,CaCl2法制備大腸桿菌DH5α新鮮感受態(tài)細胞100 μl,然后加入連接反應產(chǎn)物進行轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化產(chǎn)物均勻涂布于氨芐青霉素陽性(100 μg/ml)LB固體培基平板上,37℃倒置平板過夜培養(yǎng);第二天挑取培養(yǎng)板上數(shù)個單克隆菌落,接種至氨芐青霉素陽性(100 μg/ml)LB液體培基(10 ml),37℃,220 r/min,空氣搖床上振蕩培養(yǎng)過夜。取菌液1 μl為模板在50 μl體系中進行PCR擴增鑒定,隨機挑選獲陽性擴增結(jié)果者送樣至上海博亞生物技術(shù)公司進行序列分析。
2 結(jié) 果
2.1 RTPCR結(jié)果 TNFα刺激16HBE16 h后,與空白對照組比較,ICAM1 RTPCR產(chǎn)物表達明顯增高;先予不同濃度的EM作用于16HBE 24 h或48 h后,再用TNFα刺激16 h,與僅用TNFα刺激組比較,各組16HBE ICAM1 RTPCR產(chǎn)物表達均降低,且提示有濃度和時間依賴性。見圖1,表1。
1.Marker;2.對照組;3.TNFα(20 ng/ml16 h)刺激組;4.EM(0.3 μg/ml24 h)+TNFα(20 ng/ml16 h);5.EM(3 μg/ml24 h)+TNFα(20 ng/ml16 h);6.EM(30 μg/ml24 h)+TNFα(20 ng/ml16 h);7.EM(0.3 μg/ml48 h)+TNFα(20 ng/ml16 h);8.EM(3 μg/ml48 h)+TNFα(20 ng/ml16 h);9.EM(30 μg/ml48 h)+TNFα(20 ng/ml16 h)
2.2 RTPCR和克隆測序結(jié)果 ICAM1 RTPCR產(chǎn)物分子大小約為700 bp,與原設(shè)計產(chǎn)物分子大小490 bp不相符,進一步作克隆測序了解基因之間是否具有同源性。將ICAM1 PCR產(chǎn)物DNA序列與ICAM1基因進行blast比較,具有高度同源性,顯示PCR產(chǎn)物即為目的基因:ICAM1基因。見圖2。 表1 EM對ICAM1 mRNA表達的影響
3 討 論
細胞間黏附分子1(ICAM1)是細胞表面黏附分子,屬免疫球蛋白超家族,能與白細胞功能相關(guān)抗原1(LFA1)即(CD11a/CD18)結(jié)合發(fā)揮作用。主要分布在各種上皮細胞、血管內(nèi)皮細胞、成纖維細胞、單核巨噬細胞和淋巴細胞等,ICAM1的生物學功能包括細胞黏附,細胞分化發(fā)育,參與抗原呈遞和T細胞活化,細胞介導的細胞毒作用,炎癥等多方面。本實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn),提取16HBE細胞ICAM1mRNA進行RTPCR,RTPCR產(chǎn)物DNA序列與ICAM1基因具有高度同源性,顯示PCR產(chǎn)物即為目的基因:ICAM1基因。但兩者之間存在差異,本實驗提示,不同種族、不同組織細胞ICAM1基因表達可能具有一定差異性。