| 公開(公告)號 | CN1268765C |
| 公開(公告)日 | 2006.08.09 |
| 申請(專利)號 | CN02815270.0 |
| 申請日期 | 2002.06.28 |
| 專利名稱 | 用于確定作為抗菌藥物的D-ALA-D-ALA連接酶抑制劑的基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計方法 |
| 主分類號 | C12Q1/37(2006.01)I |
| 分類號 | C12Q1/37(2006.01)I |
| 分案原申請?zhí)? | |
| 優(yōu)先權(quán) | 2001.6.28 US 60/301,676 |
| 申請(專利權(quán))人 | 醫(yī)賢治療學(xué)公司;普利瓦股份公司 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人 | M·A·納維亞;P·J·阿拉;J·P·格利菲斯;J·A·阿里;C·H·法爾曼;S·T·莫;A·S·馬吉;P·R·康納利;E·佩羅拉 |
| 地址 | 美國馬薩諸塞州 |
| 頒證日 | |
| 國際申請 | 2002-06-28 PCT/US2002/020465 |
| 進(jìn)入國家日期 | 2004.02.03 |
| 專利代理機(jī)構(gòu) | 中國國際貿(mào)易促進(jìn)委員會專利商標(biāo)事務(wù)所 |
| 代理人 | 唐偉杰 |
| 國省代碼 | 美國;US |
| 主權(quán)項(xiàng) | 確定D-Ala-D-Ala連接酶的可能的抑制劑的方法，所述方法包括下列步驟：使用依據(jù)附圖8的限定大腸桿菌D-Ala-D-Ala連接酶的ATP結(jié)合口袋的氨基酸的原子坐標(biāo)來產(chǎn)生大腸桿菌D-Ala-D-Ala連接酶結(jié)合口袋的三維結(jié)構(gòu)，其中所述氨基酸選自Lys144、Glu180、Lys181、Leu183、Glu187、Asp257和Glu270，并且其位置與主鏈原子的均方根偏差不超過±10；在所述三維結(jié)構(gòu)和可能的抑制劑之間進(jìn)行擬合操作；和選擇可能的抑制劑，所述抑制劑結(jié)合后誘導(dǎo)大腸桿菌D-Ala-D-Ala連接酶的B結(jié)構(gòu)域向所述結(jié)合口袋進(jìn)行剛體旋轉(zhuǎn)。 |
| 摘要 | 本發(fā)明是基于下述發(fā)現(xiàn)：一些小分子可結(jié)合D-Ala-D-Ala連接酶的ATP結(jié)合位點(diǎn)，甚至在沒有酶底物存在的情況下也是如此，并且可引起類似于在ATP和底物與酶結(jié)合時所發(fā)生的酶結(jié)構(gòu)的構(gòu)象改變。雖然不希望受敷于理論，但據(jù)信，這樣的構(gòu)象改變是激活或抑制酶所必需的。從該發(fā)現(xiàn)所獲得的信息已使得能夠鑒定酶活性位點(diǎn)中的關(guān)鍵相互作用，以及設(shè)計和優(yōu)化抑制劑。 |
| 國際公布 | 2003-01-09 WO2003/002063 英 |
