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佳木斯大學是1995年6月27日，經(jīng)原國家教委批準，由佳木斯醫(yī)學院、佳木斯工學院、佳木斯師范�？茖W校和原佳木斯大學四所學校合并組成。1996年11月15日，省委任命張少杰為黨委書記、呂學詵為校長，組成新佳木斯大學領導班子。1996年11月21日，佳木斯大學正式掛牌啟動。2000年5月、2003年5月、12月佳木斯市糧食干校、富錦師范學校、黑龍江省理工學校相繼并入。
合并前的四所院校，有兩所建于建國前。佳木斯醫(yī)學院前身是1947年成立的合江軍區(qū)衛(wèi)生干部學校，1958年學校成為本科院校，1980年開始招收碩士研究生；佳木斯師范�？茖W校成立于1949年，原為佳木斯師范學校，1978年升格為佳木斯師范�？茖W校；佳木斯工學院成立于1958年，是黑龍江省第一所以農(nóng)機專業(yè)為主的工科本科院校；原佳木斯大學成立于1985年，為市屬地方職業(yè)大學。
九年來，學校占地面積由88萬平方米發(fā)展到149萬平方米，建筑面積由35萬平方米增到84.13萬平方米（含職工住宅）。固定資產(chǎn)總值由1.2億元增加到7.5億元，其中教學儀器設備總值由2200萬元增加到1.37億元。學校藏書量由70余萬冊增到298萬冊（含電子圖書82.62萬冊）。碩士學位授權點由9個增加到21個。在校生由8000多名增加到25109名。學生由以�？茷橹靼l(fā)展到以本科為主，生源由主要來自本省發(fā)展到來自全國30個�。ㄊ校�、自治區(qū)，其中外省學生已達在校生的三分之一。本科畢業(yè)生一次性就業(yè)率連續(xù)三年位居全省本科院校前六位，2004年達到91.5%。
九年來，學校把合校前隸屬關系不同、學科專業(yè)設置不同的四所院校整合為21個學院，2個直屬系，75個本�？茖I(yè)。專業(yè)設置覆蓋了文學、理學、工學、醫(yī)學、農(nóng)學、法學、經(jīng)濟學、教育學、歷史學、管理學十大學科門類。其中有省級重點學科4個、省級重點專業(yè)6個、省級重點課程12門、國家高職高專教學示范試點專業(yè)1個、省級重點實驗室1個。合校以來,累計培養(yǎng)各級各類人才2.8萬余名。
學校現(xiàn)有四個中心、32個研究所（室），衛(wèi)生部康復人才培訓中心和黑龍江省全科醫(yī)學培訓中心也坐落在我校。學校還有三個附屬醫(yī)院、附屬中小學和兩個附屬工廠，其中，第一附屬醫(yī)院是國家三級甲等醫(yī)院和黑龍江省東部地區(qū)最大的醫(yī)療救治中心，第二附屬醫(yī)院同時是全省規(guī)模最大的以治療口腔疾病為主的醫(yī)院，第三附屬醫(yī)院是國內(nèi)知名的小兒腦癱療育中心。學校建立了覆蓋全校的校園寬帶網(wǎng)和佳木斯大學網(wǎng)站，編輯出版的《佳木斯大學社會科學學報》、《佳木斯大學自然科學學報》、《黑龍江醫(yī)藥科學》在國內(nèi)外公開發(fā)行。
九年來，學校教職工發(fā)展到5080人，正高職342人，副高職933人，具有博士學位32人、碩士學位398人，其中校本部教職工3183人，專任教師為1385人，教授184人，副教授406人。先后取得科研成果近200余項，獲國家、省級科技進步獎120余項；獲國家自然基金項目2項，教育部重點項目4項，衛(wèi)生部重點項目2項，省級研究項目235項。鑲鑄截齒技術填補了國內(nèi)空白；腦癱治療水平處于國內(nèi)領先地位；我校研發(fā)的乳腺康成為暢銷全國的品牌產(chǎn)品。近三年發(fā)表學術論文1791篇，其中國家級498篇、省級1255篇，四大檢索38篇。
九年來，學校黨委連續(xù)三次被省委授予先進基層黨組織稱號，我校先后榮獲全國大中專學生志愿者社會實踐活動先進單位、全國學校及周邊治安綜合治理工作先進集體、省級文明單位標兵、全省“三五”普法標兵單位等一系列榮譽稱號， 2004年成功地舉辦了黑龍江省第十三屆大學生運動會，并獲金牌總數(shù)第一名，田徑總分第一名。九度春秋，學校經(jīng)歷了三個階段的跨越式發(fā)展：
第一階段，從1996年加入全國首批高校管理體制改革到1999年合校三周年慶典，學校堅持“積極、審慎、團結、穩(wěn)定”的合校方針，順利實現(xiàn)學科群調(diào)整，深化干部人事制度改革，實行校院兩級管理，由合校到合心，勝利完成實質(zhì)性合校。
第二階段，從2000年到2002年，學校抓住我國高等教育由精英化向大眾化戰(zhàn)略轉變的機遇，搶抓機遇，加快發(fā)展，辦學規(guī)模不斷擴大，辦學條件得到較大改善，各項事業(yè)蓬勃發(fā)展。
第三階段，從2003年至今，學校以國家本科教學工作水平評估為契機，堅持走內(nèi)涵發(fā)展道路，全面提高教育教學質(zhì)量，辦學規(guī)模、結構、質(zhì)量、效益協(xié)調(diào)發(fā)展。
經(jīng)過九年來三個階段的快速發(fā)展，學�，F(xiàn)已成為黑龍江省省屬高校中規(guī)模較大、學科齊全、人才全面素質(zhì)培養(yǎng)實力較強，融研究生教育、普通高等教育、繼續(xù)教育、職業(yè)技術教育于一體的省屬重點建設的綜合性大學。
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