第一節(jié) 蛋白質(zhì)概論 蛋白質(zhì)是所有生物中非常重要的結(jié)構(gòu)分子和功能分子,幾乎所有的生命現(xiàn)象和生物功能都是蛋白質(zhì)作用的結(jié)果,因此,蛋白質(zhì)是現(xiàn)代生物技術(shù),尤其是基因工程,蛋白質(zhì)工程、酶工程等研究的重點(diǎn)和歸宿點(diǎn)。 一、 蛋白質(zhì)的化學(xué)組成與分類(lèi) 1、 元素組成 碳 50% 氫7% 氧23% 氮16% 硫 0-3% 微量的磷、鐵、銅、碘、鋅、鉬 凱氏定氮:平均含氮16%,粗蛋白質(zhì)含量=蛋白氮×6.25 2、 氨基酸組成 從化學(xué)結(jié)構(gòu)上看,蛋白質(zhì)是由20種L-型α氨基酸組成的長(zhǎng)鏈分子。 3、 分類(lèi) (1)、 按組成: 簡(jiǎn)單蛋白:完全由氨基酸組成 結(jié)合蛋白:除蛋白外還有非蛋白成分(輔基) 詳細(xì)分類(lèi),P 75 表 3-1,表 3-2。(注意輔基的組成)。 (2)、 按分子外形的對(duì)稱程度: 球狀蛋白質(zhì):分子對(duì)稱,外形接近球狀,溶解度好,能結(jié)晶,大多數(shù)蛋白質(zhì)屬此類(lèi)。 纖維狀蛋白質(zhì):對(duì)稱性差,分子類(lèi)似細(xì)棒或纖維狀。 (3)、 功能分: 酶、運(yùn)輸?shù)鞍、營(yíng)養(yǎng)和貯存蛋白、激素、受體蛋白、運(yùn)動(dòng)蛋白、結(jié)構(gòu)蛋白、防御蛋白。 4、 蛋白質(zhì)在生物體內(nèi)的分布 含量(干重) 微生物 50-80% 人 體 45% 一般細(xì)胞 50% 種類(lèi) 大腸桿菌 3000種 人體 10萬(wàn)種 生物界 1010-1012
二、 蛋白質(zhì)分子大小與分子量 蛋白質(zhì)是由20種基本aa組成的多聚物,aa數(shù)目由幾個(gè)到成百上千個(gè),分子量從幾千到幾千萬(wàn)。一般情況下,少于50個(gè)aa的低分子量aa多聚物稱為肽,寡肽或生物活性肽,有時(shí)也罕稱多肽。多于50個(gè)aa的稱為蛋白質(zhì)。但有時(shí)也把含有一條肽鏈的蛋白質(zhì)不嚴(yán)謹(jǐn)?shù)胤Q為多肽。此時(shí),多肽一詞著重于結(jié)構(gòu)意義,而蛋白質(zhì)原則強(qiáng)調(diào)了其功能意義。
P 76 表3-3 (注意:?jiǎn)误w蛋白、寡聚蛋白;殘基數(shù)、肽鏈數(shù)。)
蛋白質(zhì)分子量= aa數(shù)目*110 對(duì)于任一給定的蛋白質(zhì),它的所有分子在氨基酸組成、順序、肽鏈長(zhǎng)度、分子量等方面都是相同的,均一性。 三、 蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象與結(jié)構(gòu)層次 蛋白質(zhì)分子是由氨基酸首尾連接而成的共價(jià)多肽鏈,每一種天然蛋白質(zhì)都有自己特有的空間結(jié)構(gòu),這種空間結(jié)構(gòu)稱為蛋白質(zhì)的(天然)構(gòu)象。
P77 圖3-1,蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象示意圖。
一級(jí)結(jié)構(gòu) 氨基酸順序 二級(jí)結(jié)構(gòu) α螺旋、β折疊、β轉(zhuǎn)角,無(wú)規(guī)卷曲 三級(jí)結(jié)構(gòu) α螺旋、β折疊、β轉(zhuǎn)角、松散肽段 四級(jí)結(jié)構(gòu) 多亞基聚集 四、 蛋白質(zhì)功能的多樣性 細(xì)胞中含量最豐實(shí)、功能最多的生物大分子。 1. 酶 2. 結(jié)構(gòu)成分(結(jié)締組織的膠原蛋白、血管和皮膚的彈性蛋白、膜蛋白) 3. 貯藏(卵清蛋白、種子蛋白) 4. 物質(zhì)運(yùn)輸(血紅蛋白、Na+-K+-ATPase、葡萄糖運(yùn)輸載體、脂蛋白、電子傳遞體) 5. 細(xì)胞運(yùn)動(dòng)(肌肉收縮的肌球蛋白、肌動(dòng)蛋白) 6. 激素功能(胰島素) 7. 防御(抗體、皮膚的角蛋白、血凝蛋白) 8. 接受、傳遞信息(受體蛋白,味覺(jué)蛋白) 9. 調(diào)節(jié)、控制細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、和遺傳信息的表達(dá)(組蛋白、阻遏蛋白) 第二節(jié) 氨基酸 一、 蛋白質(zhì)的水解(見(jiàn)P79) 氨基酸是蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位。在酸、堿、蛋白酶的作用下,可以被水解成氨基酸單體。 酸水解:色氨酸破壞,天冬酰胺、谷胺酰胺脫酰胺基 堿水解:消旋,色氨酸穩(wěn)定 酶水解:水解位點(diǎn)特異,用于一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,肽譜氨基酸的功能: (1)、 組成蛋白質(zhì) (2)、 一些aa及其衍生物充當(dāng)化學(xué)信號(hào)分子 g-amino butyric acid (g-氨基丁酸)、Serotonic(5-羥色胺,血清緊張素)、melatonin(褪黑激素,N-乙酰-甲氧基色胺),都是神經(jīng)遞質(zhì),后二者是色氨酸衍生物(神經(jīng)遞質(zhì)是一個(gè)神經(jīng)細(xì)胞產(chǎn)生的影響第二個(gè)神經(jīng)細(xì)胞或肌肉細(xì)胞功能的物質(zhì))。 Thyroxine(甲狀腺素,動(dòng)物甲狀腺thyroid gland產(chǎn)生的Tyr衍生物)和吲乙酸(植物中的Trp衍生物)都是激素(激素就是一個(gè)細(xì)胞產(chǎn)生的調(diào)節(jié)其它細(xì)胞的功能的化學(xué)信號(hào)分子)。 (3)、 氨基酸是許多含N分子的前體物 核苷酸和核酸的含氮堿基、血紅素、葉綠素的合成都需要aa (4)、 一些基本氨基酸和非基本aa是代謝中間物 精氨酸、Citrulline(瓜氨酸)、Ornithine(鳥(niǎo)氨酸)是尿素循不(Urea cycle)的中間物,含氮廢物在脊椎動(dòng)物肝臟中合成尿素是排除它們的一種重要機(jī)制。 三、 氨基酸的結(jié)構(gòu)與分類(lèi) 1809年發(fā)現(xiàn)Asp,1938年發(fā)Thr,目前已發(fā)現(xiàn)180多種。但是組成蛋白質(zhì)的aa常見(jiàn)的有20種,稱為基本氨基酸(編碼的蛋白質(zhì)氨基酸),還有一些稱為稀有氨基酸,是多肽合成后由基本aa經(jīng)酶促修飾而來(lái)。此外還有存在于生物體內(nèi)但不組成蛋白質(zhì)的非蛋白質(zhì)氨基酸(約150種)。 (一) 編碼的蛋白質(zhì)氨基酸(20種) 也稱基本氨基酸或標(biāo)準(zhǔn)氨基酸,有對(duì)應(yīng)的遺傳密碼。 近年發(fā)現(xiàn)谷胱甘肽過(guò)氧化物酶中存在硒代半胱氨酸,有證據(jù)表明此氨基酸由終止密碼UGA編碼,可能是第21種蛋白質(zhì)氨基酸。
結(jié)構(gòu)通式: 不變部分,可變部分。L-型,羧酸的α-碳上接-NH2,,所以都是L-α-氨基酸。 α-氨基酸都是白色晶體,熔點(diǎn)一般在200℃以上。 除胱氨酸和酪氨酸外都能溶于水,脯氨酸和羥脯氨酸還能溶于乙醇和乙醚。
表 20種氨基酸結(jié)構(gòu) 1、 按照R基的化學(xué)結(jié)構(gòu)分(蛋白質(zhì)工程的同源替代): (1)、 R為脂肪烴基的氨基酸(5種) Gly、Ala、Val、Leu、Ile、 圖3-2
R基均為中性烷基(Gly為H),R基對(duì)分子酸堿性影響很小,它們幾乎有相同的等電點(diǎn)。(6 .0±0.03)
P 92 表 3-7 (比較等電點(diǎn)。)
Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸,因此不具旋光性。 從Gly至Ile,R基團(tuán)疏水性增加,Ile 是這20 種a.a 中脂溶性最強(qiáng)的之一(除Phe 2.5、Trp3.4 、Tyr 2.3以外)。 (2)、 R中含有羥基和硫的氨基酸(共4種) 含羥基的有兩種:Ser和Thr。 圖3-3
Ser的-CH2 OH基(pKa=15),在生理?xiàng)l件下不解離,但它是一個(gè)極性基團(tuán),能與其它基團(tuán)形成氫鍵,具有重要的生理意義。在大多數(shù)酶的活性中心都發(fā)現(xiàn)有Ser殘基存在。 Thr 中的-OH是仲醇,具有親水性,但此-OH形成氫鍵的能力較弱,因此,在蛋白質(zhì)活性中心中很少出現(xiàn)。 Ser和Thr的-OH往往與糖鏈相連,形成糖蛋白。 含硫的兩種:Cys、Met 圖3-4
Cys中R含巰基(-SH),Cys 具有兩個(gè)重要性質(zhì): (1)在較高pH值條件,巰基離解。 (2)兩個(gè)Cys的巰基氧化生成二硫鍵,生成胱氨酸。 Cys—s—s—Cys 二硫鍵在蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)中具有重要意義。 Cys還常常出現(xiàn)在酶的活性中心。 Met的R中含有甲硫基(-SCH3),硫原子有親核性,易發(fā)生極化,因此,Met是一種重要的甲基供體。 u Cys與結(jié)石 在細(xì)胞外液如血液中,Cys以胱氨酸(Cystine)氧化形式存在,胱氨酸的溶解性最差。 胱氨酸尿(Cystinuria)是一種遺傳病,由于胱氨酸的跨膜運(yùn)輸缺陷導(dǎo)致大量的胱氨酸排泄到尿中。胱氨酸在腎(Kidney)、輸尿管(ureter)、膀胱(urinary bladder)中結(jié)晶形成結(jié)石(Calculus, calculi),結(jié)石會(huì)導(dǎo)致疼疼、發(fā)炎甚至尿血。 大量服用青霉胺(Penicillcemine)能降低腎中胱氨的含量,因?yàn)榍嗝拱放c半胱氨酸形成的化合物比胱氨酸易溶解。 青霉胺的結(jié)構(gòu) (3)、 R中含有酰胺基團(tuán)(2種) Asn、Gln 圖3-5
酰胺基中氨基易發(fā)生氨基轉(zhuǎn)移反應(yīng),轉(zhuǎn)氨基反應(yīng)在生物合成和代謝中有重要意義 (4)、 R中含有酸性基團(tuán)(2種) Asp、Glu,一般稱酸性氨基酸 圖3-6
Asp側(cè)鏈羧基pKa(β-COOH)為3.86,Glu側(cè)鏈羧基pKa(γ-COOH)為4.25 它們是在生理?xiàng)l件下帶有負(fù)電荷的僅有的兩個(gè) 氨基酸。 (5)、 R中含堿性基團(tuán)(3種) Lys、Arg、His,一般稱堿性氨基酸 圖3-7
Lys的R側(cè)鏈上含有一個(gè)氨基,側(cè)鏈氨基的pKa為10.53。生理?xiàng)l件下,Lys側(cè)鏈帶有一個(gè)正電荷(—NH3+),同時(shí)它的側(cè)鏈有4個(gè)C的直鏈,柔性較大,使側(cè)鏈的氨基反應(yīng)活性增大。(如肽聚糖的短肽間的連接) Arg是堿性最強(qiáng)的氨基酸,側(cè)鏈上的胍基是已知堿性最強(qiáng)的有機(jī)堿,pKa值為12.48,生理?xiàng)l件下完全質(zhì)子化。 His含咪唑環(huán),咪唑環(huán)的pKa在游離氨基酸中和在多肽鏈中不同,前者pKa為6.00,后者為7.35,它是20種氨基酸中側(cè)鏈pKa值最接近生理pH值的一種,在接近中性pH時(shí),可離解平衡。它是在生理pH條件下唯一具有緩沖能力的氨基酸。 His含咪唑環(huán),一側(cè)去質(zhì)子化和另一側(cè)質(zhì)子化同步進(jìn)行,因而在酶的酸堿催化機(jī)制中起重要作用。 (6)、 R中含有芳基的氨基酸(3種) Phe、Try、Trp 圖3-8 都具有共軛π電子體系,易與其它缺電子體系或π電子體系形成電荷轉(zhuǎn)移復(fù)合物( charge-transfer complex)或電子重疊復(fù)合物。在受體—底物、或分子相互識(shí)別過(guò)程中具有重要作用。 這三種氨基酸在紫外區(qū)有特殊吸收峰,蛋白質(zhì)的紫外吸收主要來(lái)自這三種氨基酸,在280nm處,Trp>Tyr>Phe。 Phe疏水性最強(qiáng).。 酪氨酸的-OH磷酸化是一個(gè)十分普遍的調(diào)控機(jī)制,Tyr在較高pH值時(shí),酚羥基離解。 Trp有復(fù)雜的π共軛休系,比Phe和Tyr更易形成電荷轉(zhuǎn)移絡(luò)合物。 (7)、 R為環(huán)狀的氨基酸(1種) Pro,有時(shí)也把His、Trp歸入此類(lèi)。 圖3-9
Pro是唯一的一種環(huán)狀結(jié)構(gòu)的氨基酸,它的α-亞氨基是環(huán)的一部分,因此具有特殊的剛性結(jié)構(gòu)。它在蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)中具有極重要的作用,一般出現(xiàn)在兩段α-螺旋之間的轉(zhuǎn)角處,Pro殘基所在的位置必然發(fā)生骨架方向的變化, u 必需氨基酸: 成年人:Leu、Ile、Val、Thr、Met、Trp、Lys、Phe 嬰兒期:Arg和His供給不足,屬半必須氨基酸。 必須氨基酸在人體內(nèi)不能合成,是由于人體內(nèi)不能合成這些氨基酸的碳架(α-酮酸) 2、 按照R基的極性性質(zhì)(能否與水形成氫鍵)20種基本aa,可以分為4類(lèi): 側(cè)鏈極性(疏水性程度) Gly 0 Ser -0.3 Glu -2.5 Lys -3.0 Ala 0.5 Asn -0.2 Asp -2.5 Arg -3.0 Met 1.3 Gln -0.2 His 0.5 Pro 1.4 Thr 0.4 Val 1.5 Cys 1.0 Leu 1.8 Tyr 2.3 Ile 1.8 Phe 2.5 Trp 3.4 (1)、 非極性氨基酸 9種,包括:甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、甲硫氨酸氨酸、脯氨酸,這類(lèi)氨基酸的R基都是疏水性的,在維持蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)中起著重要作用。 (2)、 不帶電何的極性氨基酸 6種,絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺。這類(lèi)氨基酸的側(cè)鏈都能與水形成氫鍵,因此很容易溶于水。 酪氨酸的-OH磷酸化是一個(gè)十分普遍的調(diào)控機(jī)制,Ser和Thr的-OH往往與糖鏈相連,Asn和Gln的-NH2很容易形成氫鍵,因此能增加蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性。 (3)、 帶負(fù)電荷的aa(酸性aa) 2種,在pH6~7時(shí),谷氨酸和天冬氨酸的第二個(gè)羧基解離,因此,帶負(fù)電何。 (4)、 帶正電何的aa(堿性aa) 3種,Arg、Lys、His。在pH7時(shí)帶凈正電荷。 當(dāng)膠原蛋白中的Lys側(cè)鏈氧化時(shí)能形成很強(qiáng)的分子間(內(nèi))交聯(lián)。Arg的胚基堿性很強(qiáng),與NaOH相當(dāng)。His是一個(gè)弱堿,在pH7時(shí)約10%質(zhì)子化,是天然的緩沖劑,它往往存在于許多酶的活性中心。 酶的活性中心:His、Ser、Cys 非極性aa一般位于蛋白質(zhì)的疏水核心,帶電荷的aa和極性aa位于表面。 (二) 非編碼的蛋白質(zhì)氨基酸 也稱修飾氨基酸,是在蛋白質(zhì)合成后,由基本氨基酸修飾而來(lái)。 Prothrombin(凝血酶原)中含有g(shù)-羧基谷氨酸,能結(jié)合Ca2+。 結(jié)締組織中最豐富的蛋白質(zhì)膠原蛋白含有大量4-羥脯氨酸和5-羥賴氨酸。 圖3-10 修飾aa的結(jié)構(gòu)
(1)4-羥脯氨酸
(2)5-羥賴氨酸 這兩種氨基酸主要存在于結(jié)締組織的纖維狀蛋白(如膠原蛋白)中。
(3)6-N-甲基賴氨酸(存在于肌球蛋白中)
(4)г-羧基谷氨酸 存在于凝血酶原及某些具有結(jié)合Ca2+離子功能的蛋白質(zhì)中。
(5)Tyr的衍生物: 3.5 -二碘酪氨酸、甲狀腺素 (甲狀腺蛋白中) (6)鎖鏈素由4個(gè)Lys組成(彈性蛋白中)。 (三) 非蛋白質(zhì)氨基酸 除參與蛋白質(zhì)組成的20多種氨基酸外,生物體內(nèi)存在大量的氨基酸中間代謝產(chǎn)物,它們不是蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)單元,但在生物體內(nèi)具有很多生物學(xué)功能,如尿素循環(huán)中的L-瓜氨酸和L-鳥(niǎo)氨酸。 (1)L-型α –氨基酸的衍生物 L-瓜氨酸 圖
L-鳥(niǎo)氨酸 圖 (2)D-型氨基酸 D-Glu、D-Ala(肽聚糖中)、D-Phe(短桿菌肽S) (3)β-、γ-、δ-氨基酸 β-Ala(泛素的前體)、γ-氨基丁酸(神經(jīng)遞質(zhì))。 四、 氨基酸的構(gòu)型、旋光性和光吸收 1、 氨基酸的構(gòu)型 除Gly外,19種氨基酸的α-碳原子都是不對(duì)稱碳原子,因此有兩種光學(xué)異構(gòu)體,而Thr和Ile的β-碳原子也是不對(duì)稱的,因此Thr、Ile各有兩個(gè)不對(duì)稱碳原子,有四種光學(xué)異構(gòu)體。
圖 P86 L-蘇氨酸 D-蘇氨酸 L-別一蘇 D-別-蘇
構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸均屬L-型(L-蘇氨酸),大部分游離氨基酸也是L-型。 2、 旋光性 20種氨基酸中,只有Gly無(wú)手性碳。Thr、Ile各有兩個(gè)手性碳。其余17種氨基酸的L型與D型互為鏡象關(guān)系,互稱光學(xué)異構(gòu)體(對(duì)映體,或立體異構(gòu)體)。一個(gè)異構(gòu)體的溶液可使偏振光逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)(記為(一))。另一個(gè)異構(gòu)體可使偏振光順時(shí)針旋轉(zhuǎn)(計(jì)為(+)),稱為旋光性。 光學(xué)異構(gòu)體的其它理化性質(zhì)完全相同。 外消旋物:D-型和L-型的等摩爾混合物。 L-蘇氨酸和D-蘇氨酸、L-別一蘇氨酸和D-別-蘇氨酸分別組成消旋物,而L-(D-)蘇氨酸和L-(D-)別一蘇氨酸則是非對(duì)映體。 旋光性物質(zhì)在化學(xué)反應(yīng)時(shí)經(jīng)過(guò)對(duì)稱的過(guò)度態(tài)時(shí)會(huì)發(fā)生消旋現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在與堿共熱水解時(shí)或用一般的化學(xué)方法人工合成氨基酸時(shí)也會(huì)得到無(wú)旋光性的D-、L-消旋物。。 內(nèi)消旋物:分子內(nèi)消旋 m.52667788.cn 胱氨酸有三種立體異構(gòu)體:L-胱氨酸、D-胱氨酸、內(nèi)消旋胱氨酸。 L-胱氨酸和D-胱氨酸是外消旋物 圖 P86
L-胱氨酸 D-胱氨酸 內(nèi)消旋胱氨酸:(分子內(nèi)部互相抵消而無(wú)旋光性)
蛋白質(zhì)中L型氨基酸的比旋光度
P 87 蛋白質(zhì)中L型氨基酸的比旋光度。
氨基酸的旋光符號(hào)和大小取決于它的R基的性質(zhì),并與溶液的PH值有關(guān)(PH值影響氨基和羧基的解離)。 3、 氨基酸的光吸收性 20種氨基酸在可見(jiàn)光區(qū)域無(wú)光吸收,在遠(yuǎn)紫外區(qū)(〈220nm〉均有光吸收,在近紫外區(qū)(220-300nm)只有Tyr、Phe、Trp有吸收。 Tyr、Phe、Trp的R基含有共軛雙鍵,在220-300nm紫外區(qū)有吸收。 λ(nm) ε Tyr 275 1.4×103 Phe 257 2.0×102 Trp 280 5.6×103 Lambert-Beer:
五、 氨基酸的酸堿性質(zhì)(重點(diǎn)) 1、 氨基酸在晶體和水溶液中主要以兼性離子形式存在 α-氨基酸都含有-COOH和-NH2,都是不揮發(fā)的結(jié)晶固體,熔點(diǎn)200-350℃,不溶于非極性溶劑,而易溶于水,這些性質(zhì)與典型的羧酸(R-COOH)或胺(R-NH2)明顯不同。 三個(gè)現(xiàn)象: ①晶體溶點(diǎn)高→離子晶格,不是分子晶格。 ②不溶于非極性溶劑→極性分子 ③介電常數(shù)高(氨基酸使水的介電常數(shù)增高,而乙醇、丙酮使水的介電常數(shù)降低。)→水溶液中的氨基酸是極性分子。 原因:α-羧基pK1在2.0左右,當(dāng)pH>3.5,α-羧基以-COO-形式存在。α-氨基pK2在9.4左右,當(dāng)pH<8.0時(shí),α-氨基以α-NH+3形式存在。在pH3.5-8.0時(shí),帶有相反電荷,因此氨基酸在水溶液中是以兩性離子離子形式存在。 Gly溶點(diǎn)232℃比相應(yīng)的乙酸(16.5℃)、乙胺(-80.5℃)高,可推測(cè)氨基酸在晶體狀態(tài)也是以兩性離子形式存在。 圖 2、 氨基酸的兩性解離和酸堿滴定曲線 HA A- + H+ pH=pKa/ +Log[共軛堿]/[共軛酸] pOH=pKb/+Log[共軛酸]/[共軛堿] (1)pH > pKa/ 時(shí),[堿] > [酸] pH = pKa/ 時(shí),[堿] = [酸] pH < pKa/ 時(shí), [酸] > [堿] (2) pKa/ 就是[堿] = [酸]時(shí)溶液的pH值,Ka/就是此時(shí)溶液的[H+] (3)當(dāng)[堿] = [酸]時(shí),溶液的pH值等于pKa/ (4)Gly的兩性解離和滴定曲線
圖3-14 Gly的滴定曲線 在pH2.34和pH9.60處,Gly具有緩沖能力。
滴定開(kāi)始時(shí),溶液中主要是Gly+。 起點(diǎn):100% Gly+ 凈電荷:+1 第一拐點(diǎn): 50%Gly + ,50%Gly± 平均凈電荷:+0.5 第二拐點(diǎn): 100%Gly± 凈電荷:0 等電點(diǎn)pI 第三拐點(diǎn): 50%Gly± , 50%Gly- 平均凈電荷:-0.5 終點(diǎn): 100% Gly- 凈電荷:-1
第一拐點(diǎn):pH=pK+lg[Gly±]/[Gly+],pH=pK1=2.34
第二拐點(diǎn):100%Gly±,凈電荷為0,此時(shí)的pH值稱氨基酸的等電點(diǎn)pI。
第三拐點(diǎn):pH=pK2+lg[Gly-]/[Gly±]=pK2=9.6
Gly的等電點(diǎn):
等電點(diǎn)時(shí):[Gly-]=[Gly+] 等電點(diǎn)時(shí)氫離子濃度用I表示 I2=K1·K2 PI=1/2(pK1+pK2)
氨基酸在等電點(diǎn)狀態(tài)下,溶解度最小 pH > pI時(shí),氨基酸帶負(fù)電荷,-COOH解離成-COO-,向正極移動(dòng)。 pH = pI時(shí),氨基酸凈電荷為零 pH < pI時(shí),氨基酸帶正電荷,-NH2解離成-N+H3,向負(fù)極移動(dòng)。
以Gly為例 pH>2.34 正 +1.0 — +0.5 pH=2.34 正 +0.5 2.34<PH<5.97&NBSP;&NBSP;&NBSP;&NBSP; 0 5.97<PH<9.60&NBSP;&NBSP;&NBSP;&NBSP; — -0.5 pH>9.60 負(fù) -0.5 — -1.0 問(wèn)題: (1)pH = pKa/ 時(shí),緩沖能力最大,等電點(diǎn)時(shí)緩沖能力最小。為什么? (2)pI的計(jì)算(氨基酸,寡肽),等電點(diǎn)時(shí)各組分的比例分析 (3)不同pH下的組成分析和電泳行為
pH > pI時(shí),氨基酸帶負(fù)電荷,-COOH解離成-COO-,向正極移動(dòng)。 pH = pI時(shí),氨基酸凈電荷為零,溶解度最小 pH < pI時(shí),氨基酸帶正電荷,-NH2解離成-N+H3,向負(fù)極移動(dòng)。
(4)利用pI和pKa/確定各種氨基酸適合的酸堿緩沖范圍 (5)計(jì)算不同氨基酸水溶液的pH值 (6)繪制滴定曲線(Glu)
根據(jù)P92頁(yè)表3-7中Glu的數(shù)據(jù)(pK1α-COOH 2.19, pK2α-N+H39.67,pKR R-COOH 4.25,pI 3.22) ①繪出滴定曲線 ②指出Glu-和Glu=各一半時(shí)的pH值 ③指出Glu總是帶正電荷的pH范圍 ④指出Glu±和Glu-能作為緩沖液使用的pH范圍 ①解:見(jiàn)圖 ②Glu-和Glu=各50%時(shí)pH為9.67 ③pH<3.22時(shí) Glu總帶正電荷 ④Glu±和Glu-緩沖范圍pH4.25左右
P92 表3-7,氨基酸的表觀解離常數(shù)和等電點(diǎn)
①?gòu)谋碇校≒92)可以看出,氨基酸的α-羧基pKa在1.8-2.6間,比典型羧基的pKa(如乙酸pKa為4.76)要小很多,說(shuō)明氨基酸羧基的酸性此普通羧基強(qiáng)100倍以上。主要原因是氨基酸中α-氨基對(duì)α-羧基解離的影響(場(chǎng)效應(yīng))。 圖 ②表中只有His的咪唑基側(cè)鏈在生理?xiàng)l件下不帶電荷。
在生理?xiàng)l件下,只有His有緩沖能力。 血紅蛋白中His含量高,在血液中具很強(qiáng)的緩沖能力。 六、 氨基酸的化學(xué)性質(zhì) (一) α-NH2參加的反應(yīng) 1、 ;磻(yīng) ①;噭浩S氧酰氯、叔丁氧甲酰氯、苯二甲酸酐、對(duì)-甲苯磺酰氯。這些;瘎┰诙嚯暮偷鞍踪|(zhì)的人工合成中被用作氨基保護(hù)劑。
②丹磺酰氯(DNS-cl,5—二甲基氨基萘-1-磺酰氯) DNS—cl可用于多肽鏈—NH2末端氨基酸的標(biāo)記和微量氨基酸的定量測(cè)定。 圖 N Gly—Ala—Ser—Leu—Phe C →→→→ DNS—Gly—Ala—Ser—Leu—Phe C 水解 DNS—Gly、 Ala、 Ser、 Leu、 Phe DNS-氨基酸在紫外光激發(fā)后發(fā)黃色熒光。
③蛋白質(zhì)的合成 圖
④(生物體內(nèi))在酶和ATP存在條件下,羧酸也可與氨基酸的氨基作用,形成酰基化產(chǎn)物。 苯甲酸與Gly的氨基的;磻(yīng)是生物體內(nèi)解毒作用的一個(gè)典型的例子。 將經(jīng)過(guò)勻漿的動(dòng)物肝臟組織與Gly、苯甲酸和ATP混合保溫,從混合液中可分離出N-苯甲酸一Gly。 圖
苯甲酸是食品防腐劑,在生物體內(nèi)轉(zhuǎn)變成N-苯甲酰-Gly后,可經(jīng)尿排出。 2、 烷基化反應(yīng) α-氨基中的氮是一個(gè)親核中心,能發(fā)生親核取代反應(yīng)。 ①肌氨酸是存在于生物組織中重要的組分,它是Gly甲基化的產(chǎn)物:
圖
②強(qiáng)親電的有機(jī)物能與α-NH2發(fā)生烷基化反應(yīng)。 第一次大戰(zhàn)中使用的芥子氣,它的主要作用是使氨基酸的α-氨基烷基化,從而破壞蛋白質(zhì)的正常功能。
圖
③Sanger反應(yīng)(2.4一二硝基氟苯,DNFP)
圖
二硝基苯基氨基酸(DNP-氨基酸),黃色,層析法鑒定,被Sanger用來(lái)測(cè)定多肽的NH2末端氨基酸。
④Edman反應(yīng)(苯異硫氰酸酯,PITC)
圖
苯氨基硫甲酰衍生物(PTC-氨基酸) → 苯乙內(nèi)酰硫脲衍生物(PTH-氨基酸) PTH-氨基酸,無(wú)色,可以用層析法分離鑒定。被Edman用來(lái)鑒定多肽的NH2末端氨基酸
⑤生成西佛堿的反應(yīng)(Schiff) 氨基酸的α氨基與醛類(lèi)反應(yīng),生成西佛堿。
圖
西佛堿是某些酶促反應(yīng)的中間產(chǎn)物(如轉(zhuǎn)氨基反應(yīng)的中間產(chǎn)物)。 ⑥含硫氨基酸的烷基化反應(yīng) 硫原子也是親核中心,可發(fā)生親核取代反應(yīng)。 生物體內(nèi),最重要的甲基化劑是S-腺苷甲硫氨酸(SAM),是由Met與ATP作用得到的S-烷基化產(chǎn)物。
圖
在酶催化下,SAM可以使多種生物分子的氨基甲基化,如磷脂酰膽堿的生物合成。 圖
S-腺嘌呤核苷-高半胱氨酸(比Cys多一個(gè)CH2) (二) α-羧基參加的反應(yīng) ①成鹽、成酯 分別與堿、醇作用
②成酰氯的反應(yīng)(使羧基活化) 氨基被保護(hù)后,羧基可與二氯亞砜或五氯化磷反應(yīng),生成酰氯。
圖
此反應(yīng)使氨基酸的羧基活化,易與另一個(gè)氨基酸的氨基結(jié)合,在多肽的人工合成中常用。 (三) α-NH2和α-COOH共同參加的反應(yīng) 1、 與茚三酮反應(yīng) 茚三酮在弱酸中與α-氨基酸共熱,引起氨基酸的氧化脫氨,脫羧反應(yīng),最后,茚三酮與反應(yīng)產(chǎn)物——氨和還原茚三酮反應(yīng),生成紫色物質(zhì)。(λmax=570nm)
定性、定量。 (四) 側(cè)鏈R基參加的反應(yīng)——用于蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾 (不作要求,只提一下,《陶慰孫》第四章) 七、 氨基酸的分離和分析 1、 電泳分離 電泳的基本原理
舉例:Glu、Leu 、His 、Lys,4種混合樣,在pH6.0時(shí),泳動(dòng)方向及相對(duì)速度。 Glu Leu His Lys pI 3.22 5.98 7.59 9.74
圖 2、 濾紙層析和薄層層析 分配原理 3、 離子交換層析分離氨基酸 磺酸型陽(yáng)離子交換樹(shù)脂 圖
樹(shù)脂先用含Na的緩沖液處理成鈉鹽,且pH在2左右,將氨基酸混合液(pH2-3)上柱,氨基酸此時(shí)是陽(yáng)離子,與樹(shù)脂上的鈉離子交換,被固定在樹(shù)脂上。 作用力:(1)靜電吸引,(2)氨基酸側(cè)鏈與樹(shù)脂基質(zhì)(聚苯乙烯)的疏水作用力 氨基酸分析儀 第三節(jié) 肽 peptide 一、 肽和肽鍵的結(jié)構(gòu) 肽:是由一個(gè)氨基酸的羧基和另一個(gè)氨基酸的氨基脫水縮合而成的化合物。 肽鍵:氨基酸間脫水后形成的共價(jià)鍵稱肽鍵(酰氨鍵),其中的氨基酸單位稱氨基酸殘基。 由兩個(gè)氨基酸形成的肽叫二肽, 少于10個(gè)氨基酸的肽叫寡肽, 多于10個(gè)氨基酸的肽叫多肽。
結(jié)構(gòu):P111上 5肽
主要重復(fù)單位:
側(cè)鏈R:由不同的氨基酸殘基構(gòu)成 名稱:絲氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸 寫(xiě)法: N Ser-Gly--Try-Ala---Leu或SGYAL,如果倒過(guò)來(lái)寫(xiě),則表示不同的肽,如Leu—Ala---Tyr---Gly---Ser。 肽鍵的結(jié)構(gòu)特點(diǎn): (1)酰胺氮上的孤對(duì)電子與相鄰羰基之間的共振作用,形成共振雜化體,穩(wěn)定性高。 (2)肽鍵具有部分雙鍵性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn),具有平面性。
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