1.從培養(yǎng)目標(biāo)上看：在專(zhuān)業(yè)上，臨床醫(yī)學(xué)要求掌握現(xiàn)代醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)理論、基本知識(shí)和基本技能，并能運(yùn)用所學(xué)知識(shí)和技能防治多發(fā)病、常見(jiàn)病、掌握疑難重癥的診斷治療原則等，比較側(cè)重臨床的實(shí)際應(yīng)用；而基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)要求具備自然科學(xué)、生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)科學(xué)基本理論知識(shí)和實(shí)驗(yàn)技能，側(cè)重與基礎(chǔ)性的科研。
2.課程設(shè)置也有所不同：根據(jù)專(zhuān)業(yè)的不同，每個(gè)學(xué)校都有自己設(shè)置的一套必修課和選修課，臨床醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)的偏重于臨床應(yīng)用方面的；基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)偏重于基本原理、實(shí)驗(yàn)技能方面的。但也不是絕對(duì)的，畢竟，兩者關(guān)系密切，沒(méi)有明確的界限。
范疇：
臨床醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)主要包括：臨床外科（普外、骨科、腦外、泌外、整形、心胸外……）、臨床內(nèi)科（心內(nèi)、消化、神內(nèi)、腎內(nèi)、血液、內(nèi)分泌……）、臨床專(zhuān)科（麻醉、婦兒、五官、皮膚、腫瘤、急診、老年病……）等。
基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)主要包括：解剖、病理、免疫、微生物、藥理等

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