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頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片

公開(公告)號 CN1544652A  
公開(公告)日 2004.110  
申請(專利)號 CN200310108154.4  
申請日期 2003.10.27  
專利名稱 頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片  
主分類號 C12Q1/68  
分類號 C12Q1/68  
分案原申請?zhí)?  
優(yōu)先權  
申請(專利權)人 上海第二醫(yī)科大學附屬第九人民醫(yī)院  
發(fā)明(設計)人 陳萬濤;張萍;張志愿;邱蔚六;張陳平;竺涵光;孫堅;李江  
地址 200011上海市制造局路639號  
頒證日  
國際申請  
進入國家日期  
專利代理機構 上海東亞專利代理有限公司  
代理人 董梅  
國省代碼 上海;31  
主權項 一種頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片,由與頭頸鱗癌顯著相關的一些基因序列構成相應的寡核苷酸探針,制備成小型化診斷用芯片,其特征在于,所述探針為下列寡核苷酸序列,共代表39條基因,包括:EMPCEACAM5、NA、ZNF185、ACPP、COL1A2、HPGD、TGM3、ITGA6、NMU、OPN、SCEL、COL1ACOL4A2、KRT13、PPL、PP1CYP3A5、PLAU、IL1RN、PITXMAI、BLNK、FNCOL5A2、MMPMFAP2、SERPINH2、COLAAKRT4、LAGY、C5ORF13、FAPA、SPINK5、KIAA0790、DUSP5、PTHLH、GPX3、CEACAM1。  
摘要 本發(fā)明涉及一種頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片,以及一種頭頸鱗癌分子分類診斷方法。一種頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片,由與頭頸鱗癌顯著相關的一些基因序列構成相應的寡核苷酸探針,制備成小型化診斷用芯片,所述探針為下列寡核苷酸序列,共代表39條基因。本發(fā)明采用頭頸鱗癌分子分類專用的小型診斷芯片替代傳統的高通量大芯片,顯著降低了成本,簡化了操作過程。該專用芯片的獲取系使用多種統計分析標準,多種統計學方法相結合:A和B基因群的交集和COM框架(C基因群)。通過綜合使用這些方法,保留不同統計方法敏感性高的優(yōu)點(參數/非參數/混合參數,差異平均值/平均值的差異),同時克服了不同統計學方法所帶來的假陽性率困擾。  
國際公布  
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